潔凈手術室空氣過濾器是防止微生物污染的主要手段。空氣塵埃的控制取決于用于過濾的空氣過濾器。空氣過濾器是空氣凈化過程的核心設備。

凈化系統通常具有三級空氣過濾。第—級位于新鮮空氣出口和回風口，第二級位于系統的正壓部分，第三級位于系統末端。因為空氣中的細菌一般都是成群在于，而且常常附著在灰塵，水滴，皮屑，頭發等上面。水滴和灰塵中的細菌需要營養。如果沒有營養成分，除了形成芽苞外，細菌也無法存活。

氣體中的灰塵越多，細菌和灰塵就越多。病毒附著在塵埃上的越多，塵埃就被用作生存和傳播介質。該病毒不具有尖銳的核酸酶系統，不能獨立進行物質代謝，不能在生命的媒介上生長而且病毒具有嚴格的寄生性，并且與依賴的生物物質緊密結合。

對空氣中灰塵的必要控制將不可避免地控制附著在灰塵上的微生物。旨在控制空氣中灰塵的工業潔凈室技術被引入微生物污染領域，防止灰塵被用作介質，從而形成現代化的潔凈手術室。